১৯৮১ সালের ৩০ মে চট্টগ্রাম সার্কিট হাউসে তৎকালীন রাষ্ট্রপতি জিয়াউর রহমান হত্যাকাণ্ডের ঘটনায় গ্রেপ্তার সাবেক সেনা কর্মকর্তা মেজর (অব.) মোজাফফর হোসেনকে নিয়ে চাঞ্চল্যকর তথ্য সামনে এসেছে। আন্তর্জাতিক অপরাধ ট্রাইব্যুনালের তদন্ত সংস্থায় জিজ্ঞাসাবাদে মোজাফফর জানিয়েছেন যে, হত্যাকাдের পর জিয়াউর রহমানের লাশ পাহাড় থেকে নিয়ে একটি কবরে দাফন করেছিলেন তারা। পরবর্তীতে ১৯৯৭ বা ১৯৯৮ সালের দিকে দেশে ফিরে তৎকালীন প্রধানমন্ত্রী শেখ হাসিনার সঙ্গে সাক্ষাতের চেষ্টা করেন তিনি।

আন্তর্জাতিক অপরাধ ট্রাইব্যুনালের প্রসিকিউটর তানভীর হাসান জোহা গণমাধ্যমকে জানান, সিরাজগঞ্জের সাবেক সংসদ সদস্য হাবিবে মিল্লাতের মাধ্যমে সাবেক প্রধানমন্ত্রী শেখ হাসিনার সঙ্গে মোজাফফরের সাক্ষাতের ব্যবস্থা হয়েছিল। একটি বিয়ের অনুষ্ঠানে সাক্ষাত করে শেখ হাসিনাকে স্যালুট জানানোর পাশাপাশি মোজাফফর তার করণীয় জানতে চেয়েছিলেন। সে সময় তাকে সেনাবাহিনীতে যোগদান ও আত্মসমর্পণের পরামর্শ দেওয়া হয়েছিল। যদিও পরবর্তীতে বিভিন্ন জটিলতার কারণে তার সেনাবাহিনীতে যোগদান করা হয়নি এবং তিনি দেশের ব্যবসায়িক কার্যক্রমে জড়িয়ে পড়েন। গত ১৫ জুলাই রাজধানীর বনানী থেকে মোজাফফর হোসেনকে গ্রেপ্তারের পর ট্রাইব্যুনালের জিজ্ঞাসাবাদে এসব তথ্য বেরিয়ে আসে।